Menurut rencana, pelabuhan ini akan disinggahi kapal yang berlayar dari arah wilayah timur menuju wilayah barat Indonesia, demikian juga sebaliknya.
Pelabuhan penyeberangan Pamatata saat ini berfungsi sebagai pelabuhan transit kapal feri dengan rute pelayaran pelabuhan Bira - Pamatata - Pelabuhan penyeberangan Pattumbukang - Takabonerate - Pasimasunggu Timur - Pasilambena - NTT (Reog, Sikka). Untuk sementara, pelayaran itu direncanakan akan menggunakan kapal KMP. BELLIDA dan KMP. BONTOHARU. Sementara jadwal pelayaran direncanakan 1 kali dalam seminggu, berangkat setiap hari Kamis. Mengingat kondisi perairan Selayar yang tergolong ganas, maka pelayaran akan ditunda jika cuaca tidak memungkinkan.
Menurut rencana, Dari Bira juga akan diadakan rute pelayaran tambahan yaitu Bira - Bau-Bau, Bira - Rawa Saban, Bira - Tuban, Bira - Karimunjawa, Bira - Pluan Laut, Bira - Ketapang - Dumai dengan kapal KMP. SANGKE PALLANGA. Jadwal keberangkatan dari Bira direncanakan 1 kali seminggu, setiap hari Selasa. Jadwal ini konon akan sering berubah sesuai kondisi serta keadaan penumpang yang akan berlayar ke tujuan tersebut.[1]
