Klasis Obi

Klasis Obi melayani Pulau Obi, Kabupaten Halmahera Selatan. Pdt. Esrom Lakoruhut adalah kepala Klasis Obi, dengan Pdt. Agus Luhukay sebagai sekretaris.^[3]

Klasis Pulau-Pulau Bacan

Klasis ini umumnya melayani wilayah Halmahera Selatan, khususnya Pulau Bacan. Pdt. Albert Efraim Kofit, M.Si. adalah kepala klasisnya.^[4] Jemaat-jemaat yang berhimpun dalam klasis ini, meliputi:

1. Jemaat Bibinoi^[5]
2. Jemaat Labuha^[4]

Klasis Sula

Klasis Sula dikenal pula sebagai Klasis Sula-Taliabu atau Klasis Sula, Taliabu, dan Mangoli, adalah klasis GPM yang melayani jemaat di wilayah Kabupaten Kepulauan Sula dan Kabupaten Pulau Taliabu, Provinsi Maluku Utara. Jemaat-jemaat di bawah klasis ini meliputi:

1. Jemaat Hai, pada tahun 2016 terdiri dari 26 kepala keluarga dan 104 jiwa^[6]

Klasis Ternate

Klasis Ternate memiliki wilayah pelayanan yang sepenuhnya berada di Provinsi Maluku Utara. Kepala klasis ini adalah Pdt. W. Terloit, dengan Pdt. D. Toisuta selaku sekretaris klasis.^[7] Klasis Ternate meliputi jemaat-jemaat berikut ini:^[7]

1. Jemaat Imanuel Kota Ternate
2. Jemaat Mayau
3. Jemaat Soa Tabanga
4. Jemaat Tifure

Klasis Buru Selatan

Klasis ini sesuai namanya melayani wilayah Kabupaten Buru Selatan. Jemaat-jemaat di klasis ini yaitu:

1. Jemaat Waeturen^[8]

Klasis Buru Utara

Klasis ini melayani wilayah Kabupaten Buru. Jemaat-jemaat Klasis Buru Utara antara lain:

1. Jemaat Namlea - Imanuel ^[9]

Klasis Kairatu

Klasis ini menaungi 32 jemaat yang terletak di Kecamatan Amalatu, Elpaputih, Inamosol, Kairatu, dan Kairatu Barat Kabupaten Seram Bagian Barat.^[10] Pendeta kepalanya adalah Pdt. Zeth Sahertian. Para pemuda Kristen dari klasis ini tergabung dalam Angkatan Muda Gereja Protestan Maluku (AMGPM). Ketua AMGPM Daerah Kairatu saat ini adalah Demianus Sahusilawane.^[10] Jemaat-jemaat Klasis Kairatu yaitu:

1. Jemaat Kairatu
2. Jemaat Kamal^[11]
3. Jemaat Kamarian^[12]
4. Jemaat Lohia Tala
5. Jemaat Uraur^[13]

Klasis Kota Ambon

Klasis ini membawahi 21 jemaat, yaitu:^[14]

1. Jemaat Bethabara
2. Jemaat Bethania
3. Jemaat Bethel
4. Jemaat Bukit Kasih
5. Jemaat Diakonos
6. Jemaat Ebenhaezer
7. Jemaat Eirene
8. Jemaat Getsemani
9. Jemaat Khusus Hok Im Tong di Ambon^[9]
10. Jemaat Imanuel
11. Jemaat Bukit Doa
12. Jemaat Menara Kasih
13. Jemaat Nazareth
14. Jemaat Ora Et Labora
15. Jemaat Petra
16. Jemaat Pniel
17. Jemaat Sejahtera
18. Jemaat Silo
19. Jemaat Sinar Kasih
20. Jemaat Sion
21. Jemaat Syaloom

Klasis Masohi

Klasis ini meliputi wilayah Masohi, ibu kota Kabupaten Maluku Tengah berikut daerah-daerah di sekitarnya. Ketua majelisnya adalah Pdt. Bejo Joris. Klasis Masohi melayani jemaat-jemaat berikut:

1. Jemaat Letwaru^[15]
2. Jemaat Samasuru^[16]
3. Jemaat Wasia Sanahu^[17]

Klasis Pulau Ambon Utara

Klasis Pulau Ambon Utara atau KPAU merupakan klasis yang dimekarkan dari Klasis Pulau Ambon demi kepentingan efektivitas pelayanan.^[18] Jemaat-jemaat yang tergabung di klasis ini meliputi:^[19][18]

1. Jemaat Air Manis, jumlah warga gereja 385
2. Jemaat Allang, jumlah warga gereja 3.994 jiwa
3. Jemaat Hative Besar,
4. Jemaat Hatu, jumlah warga gereja 3.140 jiwa
5. Jemaat Hila Tanah Putih, jumlah warga gereja 532 jiwa
6. Jemaat Hunuth/Durian Patah
7. Jemaat Kategorial Lapangan Udara Pattimura
8. Jemaat Lilibooi, jumlah warga gereja 2.003 jiwa
9. Jemaat Nania, jumlah warga gereja 1.055 jiwa
10. Jemaat Negeri Lama, jumlah warga gereja 1.714 jiwa
11. Jemaat Palungan Kasih, jumlah warga gereja 850 jiwa
12. Jemaat Poka, jumlah warga gereja 2.963 jiwa
13. Jemaat Rumahtiga, jumlah warga gereja 4.253 jiwa
14. Jemaat Souhoru, jumlah warga gereja 1.967
15. Jemaat Tawiri
16. Jemaat Waiheru, jumlah warga gereja 1.202 jiwa
17. Jemaat Wayame, jumlah warga gereja 2.314 jiwa

Klasis Pulau Ambon Timur

Klasis Pulau Ambon Timur merupakan klasis yang dimekarkan dari Klasis Pulau Ambon demi kepentingan efektivitas pelayanan. Kepala pendeta klasis ini adalah Pdt SI Sapulette.^[20] Klasis ini menaungi jemaat-jemaat sebagai berikut:^[20]

1. Jemaat Hutumuri

Klasis Pulau-Pulau Lease

Klasis ini terletak di Kecamatan Pulau Haruku, Nusalaut, Saparua, dan Saparua Timur, Kabupaten Maluku Tengah. Kepala pendetanya adalah Pdt. M. Tomasoa.^[21] Jemaat-jemaat dalam klasis ini meliputi:

1. Jemaat Aboru
2. Jemaat Abubu
3. Jemaat Akoon
4. Jemaat Ameth
5. Jemaat Booi - Beth El
6. Jemaat Haria^[22]
7. Jemaat Hasa (Haruku-Sameth) - Ebenhaezer
8. Jemaat Hulaliu
9. Jemaat Ihamahu - Betfage
10. Jemaat Itawaka - Maranatha
11. Jemaat Kariu^[23] - Ebenhaezer
12. Jemaat Mahu
13. Jemaat Nalahia
14. Jemaat Nolloth
15. Jemaat Oma - Pniel
16. Jemaat Ouw - Pniel
17. Jemaat Paperu
18. Jemaat Porto
19. Jemaat Pia - Ka'aba Oranje
20. Jemaat Sapti (Saparua-Tiouw) - Zebaoth
21. Jemaat Silalei (Sila-Leinitu) - Ebenhaezer
22. Jemaat Sirisori Sarani - Louhata Damai
23. Jemaat Titawaai
24. Jemaat Tuhaha - Pniel
25. Jemaat Ullath - Taman Hoea (sebelumnya Syaloom)
26. Jemaat Wassu

Klasis Seram Barat

Klasis ini terletak di Kabupaten Seram Bagian Barat. Jemaat yang tergabung dalam Klasis Seram Barat meliputi:

1. Jemaat Piru^[9]

Klasis Seram Timur

Klasis ini terletak di Kabupaten Seram Bagian Timur. Pendeta kepalanya adalah Pdt. L. W. Laisila, S.Th.^[24] Jemaat-jemaat di klasis ini meliputi:

1. Jemaat Banggoi^[24]
2. Jemaat Utta, Pulau Kesui^[25]

Klasis Taniwel

Klasis ini terletak di Kabupaten Seram Bagian Barat. Pendeta kepalanya adalah Pdt. Vicky Lesbasa. Jemaat-jemaat yang terhimpun di Klasis Taniwel, meliputi:^[26]

1. Jemaat Hulung
2. Jemaat Mornaten
3. Jemaat Nikulukan
4. Jemaat Saweli
5. Jemaat Taniwel

Klasis Telutih

Klasis Telutih adalah klasis lintas kabupaten yang menaungi tak kurang dari 20 jemaat,^[27] 14 jemaat di antaranya termasuk dalam wilayah administrasi Kabupaten Maluku Tengah, sedangkan sisanya merupakan bagian dari Kabupaten Seram Bagian Timur. Jemaat-jemaat di wilayah klasis ini antara lain:^[27]

1. Jemaat Ahinulin Naiwel
2. Jemaat Dihil
3. Jemaat Laha
4. Jemaat Maneoratu
5. Jemaat Piliana
6. Jemaat Sabuai
7. Jemaat Ulahahan

Wilayah pelayanan Klasis Telutih masih cukup berat, dikarenakan medannya yang memiliki sungai-sungai besar, yang umumnya belum terhubung jembatan.^[27]

Klasis Damer

Klasis ini berada di Kecamatan Damer, Maluku Barat Daya. Klasis Damer membawahi delapan jemaat, yaitu:^[28]

1. Jemaat Batu Merah
2. Jemaat Bebar Barat
3. Jemaat Bebar Timur
4. Jemaat Ilih
5. Jemaat Kehli
6. Jemaat Kumur
7. Jemaat Kwaimelu
8. Jemaat Wulur

Klasis Leti-Moa-Lakor

Ketua klasis ini adalah Pdt. Melky Timisela.^[29]

Klasis Luang Sermata

Klasis Luang Sermata (Luser) terletak di Kecamatan Mdona Hyera, Kabupaten Maluku Barat Daya. Ketua klasisnya adalah Pdt. Neles Mosse. Klasis ini meliputi 10 jemaat, dua di Pulau Luang, dan sisanya di Pulau Sermata.^[29] Jemaat-jemaat dalam klasis Luser antara lain:

Klasis Pulau-Pulau Aru

Wilayah pelayanan klasis ini adalah Kabupaten Kepulauan Aru. Jemaat-jemaat yang tergabung dalam klasis ini antara lain:

1. Jemaat Jabulenga^[8]
2. Jemaat Khusus Hok Im Tong di Dobo^[9]

Klasis Pulau-Pulau Babar Timur

Daerah pelayanan Klasis Pulau-Pulau Babar Timur adalah Kecamatan Pulau-Pulau Babar^[32] dan Dawelor Dawera,.^[33] Kabupaten Maluku Barat Daya. Terdapat 25 jemaat di klasis ini yang tersebar di empat pulau, Babar Besar, Marsela, Dawelor, dan Dawera,^[33] yakni sebagai berikut:

1. Jemaat Ahanari
2. Jemaat Analutur
3. Jemaat Emplawas, ketua jemaatnya adalah Pdt. Aldin Hunila^[33]
4. Jemaat Ilmarang
5. Jemaat Kokwari
6. Jemaat Kroing
7. Jemaat Letmasa
8. Jemaat Letwurung
9. Jemaat Manuweri
10. Jemaat Nakarhamto
11. Jemaat Nurnyaman
12. Jemaat Tutuwawang
13. Jemaat Wakpapapi^[32]
14. Jemaat Watuwey
15. Jemaat Welora
16. Jemaat Wiratan^[33]
17. Jemaat Yatoke

Per Mei 2022, ketua klasis ini adalah Pdt. Ny M Warella-Ubro, sementara Pdt. Ois Maskikit bertindak sebagai sekretaris klasis.^[33]

Klasis Pulau-Pulau Kei Kecil dan Kota Tual

Klasis ini terletak di Kabupaten Maluku Tenggara. Pendeta kepalanya adalah Pdt.Iwan Syahailatua.S.Th.^[34] Jemaat-jemaat dalam klasis ini, antara lain:

1. Jemaat Ohoidertavun

Klasis Pulau-Pulau Kisar

Klasis ini terletak di Kabupaten Maluku Barat Daya. Beberapa jemaat yang masuk dalam wilayah pelayanannya yaitu:

1. Jemaat Oirata^[9]

Klasis Tanimbar Selatan

Klasis ini terletak di Kabupaten Maluku Tenggara Barat. Pusat klasisnya berkedudukan di Saumlaki. Klasis ini dimekarkan dari Klasis Tanimbar pada 26 April 1973, dan diresmikan pada 28 Mei 1973. Per tahun 2013, Klasis Tanimbar Selatan membawahi 17 jemaat dengan jumlah warga gereja 29.772 jiwa dari 6.851 kepala keluarga. Jemaat-jemaat yang tergabung dalam klasis ini meliputi:^[35]

1. Jemaat Adaut
2. Jemaat Batuputih
3. Jemaat Eliasa
4. Jemaat Fursuy
5. Jemaat Kandar
6. Jemaat Latdalam
7. Jemaat Lermatang
8. Jemaat Lingat
9. Jemaat Makatian
10. Jemaat Marantutul
11. Jemaat Matakus
12. Jemaat Namtabung
13. Jemaat Saumlaki
14. Jemaat Seira
15. Jemaat Werain
16. Jemaat Wermatang
17. Jemaat Wesawak

Klasis Tanimbar Utara

Pusat klasisnya berkedudukan di Larat. Klasis ini dimekarkan dari Klasis Tanimbar pada 26 April 1973, dan diresmikan pada 28 Mei 1973.^[2]