Starfleet Academy (Akademi)

Pada awalnya, seperti dalam salah satu seri televisi Star Trek: The Original Series, setiap karakter harus mengikuti pendidikan dan pelatihan di Starfleet Academy. Lalu, pada seri-seri berikutnya dijelaskan bahwa waktu yang diperlukan untuk menyelesaikan pendidikan di akademi adalah empat tahun. Kampus utamanya terletak di Fort Baker, California.

Starfleet Command

Starfleet Command adalah pusat komando Starfleet. Pusat komando ini pertama kali diperkenalkan dalam Star Trek: The Original Series episode "Court Martial". Pusatnya terletak di Fort Baker, berdekatan dengan Golden Gate di San Fransisco, California. Sedangkan di sisi sungai yang berlawanan terletak Parlemen United Federation of Planets. Sering kali anggota Starfleet terisolasi dari Starfleet Command sehingga mereka harus bertindak tanpa perintah ataupun informasi dari Starfleet Command.

Starfleet Shipyards

Starfleet Shipyards adalah fasilitas galangan kapal yang dimiliki oleh Starfleet yang salah satunya terletak di Pulau Mare dekat San Fransisco. Galangan kapal tersebut bekerja sama dengan fasilitas perakitan kapal yang terletak di orbit bumi. Beberapa hasil dari galangan ini adalah USS Enterprise (NCC-1701) yang selesai dibuat pada tahun 2245. Kapten Robert April, kapten Enterprise yang pertama hadir di San Fransisco Navy Yards saat komponen utama pesawat tersebut dibuat dan akan dikirim ke galangan kering milik Starfleet di orbit bumi.

Utopia Planitia, merupakan fasilitas galangan kapal yang terletak di orbit planet Mars.

Starfleet Engineering Corps

Starfleet Engineering Corps (Starfleet Corps of Engineers) adalah divisi Starfleet yang bertugas pada bidang-bidang konstruksi, seperti:

• Pembuatan terowongan di dalam asteroid Regula I (Star Trek II: The Wrath of Khan)
• Desain pesawat Yellowstone (Star Trek: Voyager episode Non Sequitur)
• Pembuatan sistem pertahanan terhadap Breen (Star Trek: Deep Space Nine episode When It Rains)

Pocket books juga sudah mendistribusikan sebuah seri buku elektronik dan novel mengenai Starfleet Corps of Engineers]].

Starfleet Intelligence

Starfleet Intelligence adalah agen intelijen United Federation of Planets. Pekerjaannya seputar tugas-tugas spionase dan pengamanan, baik domestik maupun luar negeri. Pusatnya terletak di Lisbon, Portugal. (Star Trek: The Next Generation dan Star Trek:Enterprise)

Starfleet Judge Advocate General

Starfleet Judge Advocate General (Judge Advocate General Corps/JAG) adalah bagian dari Starfleet yang bertugas untuk menangani pelanggaran-pelanggaran dan hal-hal ilegal di dalamnya.^[1] Berikut ini adalah beberapa episode yang menampilkan Starflet Judge Advocate General:^[1]

• Kapten James T. Kirk disidang oleh JAG dalam Star Trek:The Original Series episode Court Martial,
• Data berpartisipasi dalam dengar pendapat JAG mengenai kepemilikan dirinya oleh Starfleet dalam Star Trek: The Next Generation episode The Measure of a Man]],^[1]
• Dengar pendapat untuk memutuskan ekstradiksi Worf ke Klingon dalam Star Trek: Deep Space Nine episode Rules of Engagement^[1],dan
• Dalam Episode Doctor Bashir, I Presume? JAG menghukum Bashir dan anaknya, Julian, atas tuduhan genetik ilegal Julian.^[1]

Starfleet Medical

Starfleet Medical adalah cabang dari Starfleet yang bertugas pada bidang medis.^[1]

Gamtes McFadden yang memerankan Dr. Beverly Crusher meningggalkan Star Trek: The Next Generation pada musim kedua dan kembali pada kemudian hari.^[1] Dijelaskan bahwa pada musim kedua Crusher sedang diperkerjakan di Starfleet Medical^[1]

Starfleet Operations

Starfleet Operations adalah bagian dari Starfleet.^[1] Admiral James T. Kirk bekerja selama delapan belas bulan sebagai Starfleet's Chief of Operation.^[2]

Starfleet Security

Starfleet Security adalah agen Starfleet yang tampil pada beberapa episode Star Trek: The Next Generation dan Star Trek: Deep Space Nine. Bahkan, divisi ini sudah diperkenalkan sejak Star Trek: The Original Series. Beberapa karakter utama dalam episode tertentu menjadi bagian dari divisi ini.

Starfleet Tactical

Starfleet Tactical adalah salah satu departemen Starfleet yang jarang ditampilkan. Departemen ini bertanggungjawab atas stategi pertahanan dan riset senjata.