Manjaly lahir pada 7 Februari 1958 di Kerala, India, dari pasangan Kathreena dan M.V. Chacko.[4] Ia menerima pendidikan dasar di Sekolah Santo Fransiskus Xaverius, Vendore, Kerala dan merampungkan sekolah tingginya dari Sekolah Tinggi Tyagarajar, Alagappanagar, Trichur, Kerala. Ia bergabung dengan Seminari Minor St. Lawrence, Agra, pada 1973 dan merampungkannya pada tahun 1975. Ia bergabung dengan Seminari Regional Santo Yosef, Allahabad, pada 1975 dan merampungkan pendidikan filsafat dan teologi pada tahun 1983. Ia merampungkan kelulusan dan pasca kelulusannya dari Universitas Agra. Ia menerima gelar doktor dalam bidnag spiritualitas dari Universitas Angelicum, Roma.[5]
Manjaly diangkat menjadi uskup Varanasi pada 24 Februari 2007 dan ditahbiskan pada 30 April 2007. Ia diangkat menjadi uskup Allahabad pada 17 Oktober 2013 dan dilantik pada 3 Desember 2013.[6][7] Ia diangkat menjadi Uskup Agung Agra pada 12 November 2020 dan dilantik pada 7 Januari 2021.
