Pada 4 November 2020, Irinej dinyatakan positif COVID-19 setelah menghadiri pemakaman MetropolitAmfilohije pada 1 November, yang meninggal karena COVID-19.[5][6] Kerumunan besar dalam pemakaman Amfilohije tidak mempraktikkan pembatasan sosial atau memakai masker.[7] Pada 19 November, ia diintubasi.[7] Beberapa media melaporkan bahwa Irinej telah meninggal; Gereja Ortodoks Serbia mengeluarkan pernyataan yang membantah klaim ini, tetapi mengatakan bahwa kesehatan Irinej memburuk di sebuah rumah sakit militer di Beograd.[8]
Irinej meninggal dunia pada 20 November pukul 7:07 pagi.[6][7][9] Pemakamannya akan dilakukan pada 22 November di Gereja Santo Sava di Beograd.[10]
