Kehidupan
Maria Anna adalah putri Albrecht V dari Bayern dan Anna dari Austria. Dia mendapat pendidikan dasar dalam bahasa Latin dan agama, serta pendidikan tinggi dalam musik, kemungkinan oleh Orlando de Lassus.
Pada 26 Agustus 1571 di Wina, Maria Anna menikah dengan pamanda dari pihak ibundanya, Karl II dari Austria. Pernikahan itu diatur untuk memberi Karl dukungan politik di Bayern.
Hubungan antara Maria Anna dan Karl dikabarkan harmonis. Maria Anna digambarkan sebagai orang yang percaya diri, ambisius, dan sangat menyukai kemegahan dan kekuasaan, dan seorang umat Katolik yang taat. Dia ikut serta dalam urusan negara, dan berhasil mendapatkan keuntungan dari reformasi tandingan yang kuat di wilayah pasangannya. Dia melanjutkan pendidikannya di bidang musik, memberi manfaat kepada sekolah Yesuit di Graz, dan menghabiskan waktunya dalam ibadah keagamaan dan amal.
Maria Anna menjanda pada tahun 1590. Dia terus berpartisipasi dalam politik sebagai penasihat putranya dan mendorongnya untuk melanjutkan kontra-reformasi dan bekerja melawan rahib dan bangsawan Protestan. Pada tahun 1608, ia mengundurkan diri ke Biara St Clare di Graz. Korespondensinya sebagian diawetkan.