Klub ini dinamai untuk menghormati Guillermo Brown yang merupakan laksamana pertama kelahiran Irlandia di Argentina pada pertengahan abad ke-19.
Brown finis di puncak grup mereka di Clausura 2006 untuk Torneo Argentino A, tetapi gagal di tahap berikutnya, setelah dikalahkan oleh San Martín de Tucumán di seri playoff dengan skor 0–3 dan 2–2.