Karim Hafez memulai karier seniornya bersama klub Belgia Lierse pada tahun 2014. Selama membela Lierse, ia beberapa kali dipinjamkan, yakni ke klub Siprus Omonia pada musim 2015–2016 serta ke klub Prancis Lens pada musim 2016–2017 dan 2017–2018. Pada tahun 2018, ia bergabung dengan Wadi Degla, tetapi kembali menjalani masa peminjaman ke Basaksehir, Kasimpasa, dan Yeni Malatyaspor. Setelah masa peminjamannya berakhir, Yeni Malatyaspor mempermanenkannya pada tahun 2020. Sejak tahun 2022, ia memperkuat Pyramids.
