Francis Joseph Monaghan (30 Oktober 1890 – 13 November 1942) adalah seorang prelat Gereja Katolik Roma Amerika Serikat. Ia menjabat sebagai uskup Keuskupan Ogdensburg di New York Utara dari 1939 sampai 1942. Pada masa sebelumnya, Monaghan menjabat sebagai Presiden Seton Hall University di New Jersey dari 1933 sampai 1936.
Kembali ke New Jersey pada 1915, ia diangkat menjadi asisten pastor Paroki Santo Paulus dari Salib di Jersey City, New Jersey. Ia diangkat menjadi asisten pastor selama beberapa bulan pada 1926 di Paroki Santa Maria di Roselle, New Jersey. Namun, kemudian pada tahun tersebut, ia meninggalkan Paroki Santa Maria untuk menjadi profesor teologi dogmatik dan metafisika di Immaculate Conception Seminary, Seton Hall. Monaghan kemudian menjabat sebagai presiden Seton Hall College dari 1933 sampai 1936.[1] Ia diangkat menjadi chamberlain kepausan pada 1934.[1] Pada tahun yang sama, ia meneriam gelar Doctor of Laws dari St. Peters College di Jersey City, New Jersey.[4]
Pada 26 September 1942, Monaghan terkena cedera otak traumatik saat ia jatuh dari peron kereta di Watertown, New York. Ia menjadi pasien di Mercy Hospital, Watertown pada satu setengah bulan berikutnya. Pada 13 November 1942, Francis Monaghan meninggal akibat pendarahan otak dan serangan jantung dalam usia 52 tahun.[1][4]