Etienne III (meninggal tahun 1241) adalah seorang Comte Auxonne. Ia berasal dari Wangsa Ivrea, putra Etienne II, Comte Auxonne (meninggal setelah 1173) dan Judith dari Lorraine (skt. 1140 – 1173).
Ayahandanya, Etienne II dari Auxonne adalah putra Guillaume III, Comte Mâcon dan istrinya Poncette/Alice, Lady Traves. Ibundanya Judith adalah putri Mathieu I, Adipati Lorraine dan Bertha Hohenstaufen (putri Friedrich II, Adipati Swabia).
Etienne III menikah pertama-tama (skt. tahun 1186) dengan Beatrice, Comtesse Châlon (putri Guillaume, Comte Chalon & Beatrix putri Friedrich baronessa kaisar dari Kekaisaran Romawi Suci), tetapi mereka bercerai pada tahun 1197/1200. Ia menikah kedua kalinya (sebelum tahun 1212) dengan Agnes dari Dreux (1195-1258), putri Robert II, Comte Dreux dan istri kedua Yolande de Coucy.
Etienne hanya memiliki keturunan dari pernikahan pertamanya dengan Beatrice, Comtesse Châlon:[1]