C-terminus (juga dikenal sebagai karboksil-terminus, ekor C-terminal, atau COOH-terminus) adalah ujung dari rantai asam amino (protein atau polipeptida) yang diakhiri oleh gugus karboksil bebas (-COOH). Saat protein ditranslasi dari mRNA (RNA duta), protein tersebut dibentuk mulai dari N-terminus menuju C-terminus. Konvensi penulisan urutan peptida adalah dengan menempatkan C-terminus di sebelah kanan dan menuliskan urutan dari N-terminus ke C-terminus.

Kimia

Setiap asam amino memiliki gugus karboksil dan gugus amina. Asam-asam amino saling terhubung membentuk rantai melalui reaksi dehidrasi yang menyatukan gugus amina dari satu asam amino dengan gugus karboksil dari asam amino berikutnya. Dengan demikian, rantai polipeptida memiliki satu ujung dengan gugus karboksil yang tidak terikat (C-terminal) dan satu ujung dengan gugus amina yang tidak terikat N-terminus. Secara alami, protein disintesis mulai dari N-terminus dan berakhir di C-terminal.^[1]

Fungsi

Domain C-terminal

Domain C-terminal pada beberapa protein memiliki fungsi khusus. Pada manusia, CTD (domain C-terminal) dari RNA polimerase II biasanya terdiri dari hingga 52 pengulangan urutan Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser.^[3] Hal ini memungkinkan protein lain untuk berikatan dengan domain C-terminal RNA polimerase guna mengaktifkan aktivitas polimerase. Domain-domain tersebut kemudian berperan dalam inisiasi transkripsi DNA, penambahan tudung pada transkrip RNA, serta penempelan pada splisosom untuk penjalinan RNA.^[4]

Lihat juga

• N-terminus
• TopFIND: sebuah pangkalan data ilmiah yang mencakup protease, spesifisitas situs pemotongan, substrat, penghambat, serta ujung protein yang dihasilkan dari aktivitas protease tersebut.

Referensi