Ketika Perang Dunia II pecah, ia bergabung dengan Kementerian Udara sebagai perwira ilmiah yang mengembangkan radar untuk penerbangan malam. Setelah perang ia menjadi asisten direktur di Cambridge University sebelum pindah ke Leicester University, di mana ia menjadi penasihat.
Penelitian
Sir Hodgkin, yang memulai penelitiannya dalam sistem saraf sebelum perang, bekerja dengan bekas mahasiswanya Sir Andrew Huxley, meneliti "teori ion" bagaimana serabut saraf mengirim pesan ke otak melalui "kabel listrik" di medulla spinalis.