Alur Cerita
Sebuah stasiun pemantau Starfleet mendeteksi alien yang bersembunyi di dalam sebuah awan raksasa bertenaga tinggi dan awan tersebut mengarah ke bumi. Sementara itu, di bumi, USS Enterprise (NCC-1701) sedang mengalami renovasi total dan James T. Kirk sudah dipromosikan menjadi admiral dan bekerja di San Fransisco sebagai Kepala Operasi Starfleet. Starfleet memerintahkan Enterprise untuk menyelediki awan tersebut.
Kirk mengambil alih komando Enterprise dengan dalih pengalamannya sehingga Kapten Willard Decker marah. Enterprise sendiri juga belum berada dalam kondisi prima, beberapa uji coba berjalan dengan buruk; dua petugas meninggal karena malafungsi transporter. Ketidakcocokan Kirk dengan Decker semakin meningkat saat Kirk terlihat tidak terbiasa dengan Enterprise.
Tiba-tiba, sebuah pesawat mendekati Enterprise. Ternyata pesawat tersebut membawa Spock untuk mengisi jabatan petugas sains. Spock menjelaskan bahwa ia sedang melakukan ritual penghapusan emosi di Vulcan saat ia merasakan akan menemukan jawaban atas semua pernyataannya di dalam awan tersebut.
Enterprise berhasil menghadang awan energi tersebut dan diserang. Bahkan, sebuah pemantau menyusup ke anjungan, menyerang Spock, dan akhirnya menculik Ilia, navigator pesawat. Ia digantikan oleh robot pemantau yang dikirm "V'ger" untuk mempelajari segala sesuatu mengenai Enterprise. Sementara itu, Decker merasa sangat sedih karena cintanya, Ilia meninggal.
Spock berjalan dengan pakaian luar angaksa ke arah V'ger dan menemukan bahwa seluruh awan/pesawat tersebut adalah V'ger, mesin yang hidup. Akhirnya, setelah dibujuk, robot pemantau yang mirip Ilia berhasil dibujuk untuk membawa awak penting Enterprise ke pusat dari V'ger. Ternyata, V'ger adalah Voyager 6, sebuah satelit yang diluncurkan dari bumi pada abad ke-20. Sejarah mencatat bahwa Voyager 6 hilang. Voyager 6 ditemukan oleh alien berbentuk mesin yang menginterpretasi progam Voyager; mempelajari sebanyak mungkin dan memberikan informasi tersebut ke penciptanya. Alien mesin tersebut memuktahirkan Voyager sehingga Voyager mempelajari banyak sekali hal sampai memperoleh kesadaran.
Spock menyadari bahwa V'ger sangat fokus untuk menuntaskan misinya. Karena itu, V'ger terus-menerus mencari penciptanya dan bersikeras bahwa penciptanya akan datang dalam wujud manusia. Akhirnya, awak Enterprise sadar bahwa V'ger ingin menyatukan diri dengan penciptanya. Deckerpun menyatukan dirinya dengan V'ger dan robot pemantau Ilia. Merekapun menghilang ke dimensi lain. Bumi berhasil diselamatkan, dan Kirk memerintahkan Enterprise untuk melaksanakan misi berikutnya.[2]
