Ibu kota provinsi berada di lokasi yang berdekatan dengan tempat yang sekarang disebut kota Imabari. Di zaman Sengoku, Iyo dibagi-bagi menjadi wilayah kecil dengan wilayah kekuasaan terbesar berpusat di Istana Matsuyama. Iyo sempat dipersatukan klan Chosokabe yang berkedudukan di Tosa, tetapi kembali dibagi-bagi menjadi beberapa wilayah kecil setelah Toyotomi Hideyoshi menaklukkan Shikoku pada tahun 1584.
