Paperu diperintah oleh raja yang berasal dari matarumah parentah (fam) Lawalata.
Soa
Soa adalah sebuah kelompok yang terbangun di dalam sebuah negeri dan merupakan budaya khas orang Maluku Bagian Tengah. Soa menghimpun beberapa marga dan biasanya marga” dalam satu soa memiliki kesamaan atau pertalian sejarah. Di Negeri Paperu terdapat 10 soa, empat di antaranya telah hilang.[3] Berikut adalah soa yang ada di Paperu.
