Panda bersekolah di SMP Nasrani Medan dan lulus dari sekolah itu pada 1959. Setelah itu, ia melanjutkan pendidikan SMA di lembaga pendidikan yang sama dan lulus pada 1962. Setelah lulus SMA, ia sempat melanjutkan pendidikan kuliah di Universitas HKBP Nommensen di Pematangsiantar hingga 1963. Kemudian, Panda pindah ke Jakarta dan melanjutkan perkuliahan di Universitas Bung Karno hingga 1966. Tidak sampai di sana, Panda berpindah lagi dan melanjutkan pendidikan di Perguruan Tinggi Publisistik, Jakarta sepanjang tahun 1968—1969. Pada 1979, Panda memperoleh kesempatan untuk mendalami studi jurnalistik di NRC Handelsblaad, Rotterdam.
Pekerjaan
Panda pernah bekerja sebagai wartawan di harian umum Warta Harian (1969—1970), menjadi Redaktur Harian Umum Sinar Harapan, (1970—1987), Wakil Pemimpin Umum Harian Umum Prioritas (1987—1988), dan Kepala Litbang Media Indonesia (1988—1989). Salah satu puncak prestasinya sebagai wartawan ialah ketika ia memperoleh penghargaan jurnalistik Hadiah Adinegoro pada 1976.
Panda Nababan menikah dengan Ria Purba dan mempunyai tiga orang anak, yaitu Putri, Putra, dan Anggi. Panda Nababan merupakan saudara kandung dari S.A.E. Nababan dan Asmara Nababan.
Riwayat pendidikan
Pendidikan Formal
SMP Nasrani, Medan, Sumatera Utara (1956-1959)
SMA Nasrani, Medan (1959-1962)
Universitas Nommensen, Medan (1962-1963)
Universitas Bung Karno, Jakarta (1963-1966)
Perguruan Tinggi Publisistik, Jakarta (1968-1969)
Jurnalistik NRC Handelsblaad, Rotterdam (1979)
Pendidikan Non Formal
Kursus Manajemen LPPM-2, Jakarta (1981)
Kursus Manajemen LPPM-2, Jakarta (1983)
Kursus Manajemen LPPM-2 bidang Problem Solving, Jakarta (1987)
Karier
Anggota Bamus DPR RI.
Anggota Fraksi PDIP DPR RI.
Anggota Fraksi PDIP MPR RI.
Anggota Komisi II (Hukum dan Dalam Negeri) DPR RI.
Anggota Sub Komisi Hukum DPR RI.
Anggota Sub Komisi Otonomi Daerah DPR RI.
Anggota Sub Komisi Dalam Negeri DPR RI.
Anggota Sub Komisi Pertanahan DPR RI.
Anggota Sub Komisi Kepegawaian DPR RI.
Anggota Komisi III DPR Periode 2009-2014.
Anggota DPR RI dari Fraksi Partai Demokrasi Indonesia Perjuangan A-125.
Wartawan Harian Umum Warta Harian, Jakarta, 1969-1970.
Redaktur Harian Umum Sinar Harapan, Jakarta, 1970-1987.
Wakil Pemimpin Umum Harian Umum Prioritas, Jakarta, 1987-1988.
Kepala Litbang Media Indonesia, Jakarta, 1988-1989.
Wakil Pemimpin Umum Majalah Forum Keadilan, 1990-1999.
Pemegang Saham Majalah Forum Keadilan, Jakarta, 1990-sekarang.
Riwayat Organisasi
Anggota GMKI, Medan, 1963.
Ketua Departemen Organisasi Gerakan Mahasiswa Bung Karno, Jakarta, 1963-1966.
Anggota PWI, Jakarta, 1970-197.
Anggota PDI, Jakarta, 1993-1998.
Anggota PDIP, Jakarta, 1998-sekarang.
Penghargaan
Adinegoro Trophy (1976)
Kasus Korupsi
Panda Nababan menerima suap berupa Traveller Cheque (TC) dalam kasus pemilihan Deputi Gubernur Senior Bank IndonesiaMiranda Goeltom pada tahun 2004. Atas kasus korupsi tersebut, Panda Nababan divonis bersalah dan dihukum penjara selama 17 bulan.[3]