Wilayah Kelurahan Pakembaran terdiri dari enam dukuh yaitu Dukuh Kalijembangan, Dukuh Mingkrik, Dukuh Kemanglen, Dukuh Kembaran, Dukuh Cergomas, dan Dukuh Karang Jongkeng.[butuh rujukan]
Dukuh Kemanglen
Dukuh Kemanglen merupakan pusat pemerintahan Kelurahan Pakembaran. Di Dukuh Kemanglen terdapat Kantor Kelurahan Pakembaran. Dukuh Kemanglen juga memiliki lokasi bekas Pabrik Gula Kemanglen yang dihancurkan oleh Jepang pada tahun 1942.[butuh rujukan]
