Pada September 2001, Mimica diangkat sebagai Menteri Integrasi Eropa di bawah Perdana Menteri Ivica Račan, jabatan yang dipegangnya hingga Desember 2003.
Anggota Komisi Eropa, 2013–2019
Pada 1 Juli 2013, Mimica menjadi Komisaris Eropa untuk Perlindungan Konsumen dalam Komisi Barroso II. Dalam kapasitas ini, ia bertanggung jawab atas pasar konsumen, teknologi kesehatan dan kosmetik, keamanan produk dan jasa, layanan keuangan, serta strategi dan penegakan kebijakan konsumen.[7]
Selama masa jabatannya, ia mengawasi penerapan undang-undang konsumen Uni Eropa dan melanjutkan proses legislasi yang telah diusulkan sebelumnya.[8]
László Andor menjabat sebagai Komisaris Sementara selama masa kampanye Mimica untuk pemilihan Parlemen Eropa 2014.[9] Namun, ia akhirnya memutuskan untuk tidak mengambil kursinya di Parlemen.
Sejak 1 November 2014, Mimica menjabat sebagai Komisaris Eropa untuk Kerja Sama dan Pembangunan Internasional dalam Komisi Juncker yang dipimpin oleh Jean-Claude Juncker, di mana ia menjadi bagian dari kebijakan luar negeri Komisi di bawah koordinasi Federica Mogherini.[10]
Pada awal masa jabatannya, Uni Eropa menyetujui bantuan sebesar 1,15 miliar euro untuk Afrika Barat melalui program Dana Pembangunan Eropa lima tahun 2015.[11]
Pada akhir tahun 2015, ia menegosiasikan perjanjian bantuan senilai 200 juta euro dengan Eritrea untuk mengurangi arus migrasi ke Eropa.[12]
Sejak 2016, ia juga memimpin pelaksanaan Dana Amanah Darurat Uni Eropa untuk Afrika senilai 44 miliar euro untuk menarik investasi swasta ke negara-negara termiskin dan memperlambat migrasi massal ke Eropa.[13]
Selama masa jabatannya, Uni Eropa juga menangguhkan bantuan langsung untuk pemerintah Burundi karena krisis politik setelah pemilu 2015.[14]
Pada September 2016, Mimica ditunjuk oleh Sekretaris Jenderal PBB Ban Ki-moon sebagai anggota Kelompok Pimpinan Gerakan Peningkatan Gizi Global.[15]
Menjelang akhir masa jabatannya pada 2019, Mimica menjanjikan kontribusi sebesar 500 juta euro dari Uni Eropa kepada Dana Global untuk Memerangi AIDS, Tuberkulosis, dan Malaria untuk periode 2020–2022.[16]