Marie menikah pada tanggal 24 Juni 1275, dengan Philippe III dari Prancis. Ini merupakan pernikahan kedua Philippe, setelah kematian istri pertamanya, Isabel dari Aragon. Isabel telah melahirkan tiga orang anak: Louis, Philippe dan Charles.
Philippe berada di bawah pengaruh kuat ibundanya, ibu suri Marguerite dari Provence dan kekasihnya, dokter bedah dan bendahara Pierre de La Broce (atau Pierre de Brosse). Meskipun bukan orang Prancis, Marie menonjol di istana kerajaan Prancis.
Pada tahun 1276, putra dan pewaris Philippe, Louis meninggal, dalam keadaan mencurigakan. Marie dicurigai memerintahkan untuk meracuninya. La Brosse, yang juga dicurigai, dipenjara dan kemudian dieksekusi atas pembunuhan tersebut. Marguerite mencurigai Marie memerintahkan untuk membunuh Louis dan Philippe kelihatannya lebih setuju dengan ibundanya daripada istrinya.
Setelah kematian Philippe III pada tahun 1285, Marie kehilangan pengaruh politiknya, dan mendedikasikan dirinya untuk ketiga anak-anaknya. Anak tirinya, Philippe dimahkotai sebagai raja Prancis, sebagai Philippe IV, pada tanggal 6 Januari 1286 di Reims. Marie hidup selama masa pemerintahan Philippe IV dan ia hidup lebih lama dari ketiga anak-anaknya.
Marie meninggal pada tahun 1321, usia 61 tahun, di dalam biara Les Mureaux, dekat Meulan, dimana ia mengundurkan diri pada tahun 1316. Marie tidak dimakamkan di royal necropolis Basilika Santo Denis, tetapi di dalam Couvent des Cordeliers, di Paris. Biara tersebut hancur terbakar pada tahun 1580, gereja itu dibangun kembali pada tahun berikutnya.
