Saat berstatus mahasiswa, Manske adalah salah satu kontributor pertama ensiklopedia Internet NuPedia, pendahulu Wikipedia, dan menulis kode salah satu versi terawal perangkat lunak MediaWiki yang digunakan oleh Wikipedia.[9] Manske bekerja di Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, sejak April 2007,[10][11][12][13][14] tetapi masih aktif dalam pengembangan perangkat lunak untuk Wikipedia.[15]
Pada tahun 2012, Manske turut berkontribusi dalam sebuah makalah Nature yang membahas cara baru mengenali wilayah-wilayah pertumbuhan parasit malaria dan menjelaskan teknik pemetaan resistensi obat malaria. Para peneliti mengembangkan teknik khusus untuk mengambil DNA parasit malaria langsung dari darah sehingga meminimalkan kesalahan pengurutan DNA.[10][16]
