Kompetisi ini diikuti 32 tim di babak penyisihan grup.[3] Juara akan diberikan slot babak pendahuluan tidak langsung untuk Liga Champions Elit AFC 2026–2027, jika mereka tidak memenuhi syarat melalui kompetisi domestiknya.[4]
Sharjah adalah juara bertahan. Mereka tidak dapat mempertahankan gelarnya karena mereka malah berpartisipasi dalam babak liga Liga Champions Elit AFC.
Alokasi tim asosiasi
Asosiasi dialokasikan slot sesuai dengan peringkat kompetisi klub yang diterbitkan setelah kompetisi 2023–24 selesai.[5][6] Slot dapat diseimbangkan ulang berdasarkan hasil kompetisi 2024–25.
Partisipasi untuk Liga Champions Dua AFC 2025–2026
^Lisensi AFC (AFC): Asosiasi tidak memiliki klub berlisensi.[7]
^Thailand (THA): Slot tidak langsung Korea Utara yang tidak masuk didistribusikan kembali ke Asosiasi Anggota yang paling memenuhi syarat.[8] Tim Thailand dengan slot tambahan tidak langsung menerima bye di babak play-off karena jumlah tim peserta tidak mencukupi.
Tim
Jumlah penampilan dan penampilan terakhir termasuk Piala AFC sebagai pendahulu Liga Champions Dua AFC.
^Arab Saudi (KSA): Sebagai juara Piala Raja Saudi 2024–25, Al-Ittihad lolos ke Liga Champions Elit melalui posisi mereka di liga, maka tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi juara Piala Raja dialihkan kepada tim peringkat ketiga di Liga Pro Saudi 2024–25.
^Jepang (JPN): Sebagai juara Piala Kaisar 2024, Vissel Kobe lolos ke Liga Champions Elit melalui posisi mereka di liga, maka tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi juara Piala Kaisar dialihkan kepada tim peringkat keempat di J1 League 2024.
^Qatar (QAT): Karena peraih peringkat ketiga musim reguler, Al-Gharafa, lolos ke Liga Champions Elit sebagai juara Piala Emir Qatar 2025, maka tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi tim peringkat ketiga dialihkan kepada tim peringkat keempat di Liga Bintang Qatar 2024–25.
^Singapura (SGP): Sebagai juara Piala Singapura 2024–25, Lion City Sailors lolos ke Liga Champions Dua melalui posisi mereka di liga, maka tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi juara Piala Singapura dialihkan kepada runner-up Liga Utama Singapura 2024–25.
^Tiongkok (CHN): Sebagai juara Piala FA Tiongkok 2024, Shanghai Port lolos ke Liga Champions Elit melalui posisi mereka di liga, sehingga tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi juara Piala FA Tiongkok dialihkan ke tim peringkat keempat di Liga Super Tiongkok 2024.
^Turkmenistan (TKM): Karena Arkadag menjuarai Liga Challenge AFC 2024–2025, Ýokary Liga 2024, dan Piala Turkmenistan 2024, dan karena Turkmenistan tidak memiliki slot langsung ke LCDA berdasarkan peringkat wilayahnya, satu slot langsung tambahan ke LCDA dialokasikan untuk Turkmenistan bagi Arkadag, dan tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi juara Ýokary Liga dialihkan kepada runner-up, Ahal.
^Uni Emirat Arab (UAE): Sebagai juara Piala Presiden UEA 2024–25, Shabab Al Ahli dan Sharjah lolos ke Liga Champions Elit masing-masing melalui posisi mereka di liga dan sebagai juara edisi sebelumnya dari kompetisi ini, maka tempat yang seharusnya diperuntukkan bagi juara Piala Presiden UEA dialihkan kepada tim peringkat ketiga di Liga Pro UEA 2024–25. Tempat yang semula diperuntukkan bagi tim peringkat ketiga kemudian dialihkan kepada tim peringkat keempat.
Jadwal
Jadwal kompetisi adalah sebagai berikut.[10] Semua pertandingan dimainkan pada hari Selasa, Rabu, dan Kamis, kecuali final yang berlangsung pada hari Minggu.
Tiga pemenang dari babak play-off (dua dari Wilayah Barat dan satu dari Wilayah Timur) akan melaju ke babak grup untuk bergabung dengan 29 tim yang lolos langsung. Tim yang kalah di babak play-off kualifikasi akan masuk ke babak grupLiga Challenge AFC 2025–2026.
Lokasi tim babak grup Liga Champions Dua AFC 2025–2026 Cokelat: Grup A; Biru kehijauan: Grup B; Oranye: Grup C; Kuning: Grup D; Merah muda: Grup E; Hijau: Grup F; Biru: Grup G; Merah: Grup H
↑Pada 27 September 2025, AFC mengumumkan bahwa Mohun Bagan SG dianggap telah mengundurkan diri dari Liga Champions Dua AFC setelah mereka gagal hadir dalam pertandingan melawan Sepahan di Isfahan. Pertandingan tersebut dinyatakan batal.[12]