Keuskupan Agung Zamboanga (nama Latin: Archdiœcesis Zamboangensis) adalah sebuah keuskupan agung Katolik di Filipina. Yurisdiksi saat ininya meliputi Kota Zamboanga, dengan sufragan-sufragan di Basilan (Prelatur Teritorial Isabela, Basilan), dan Zamboanga Sibugay (Keuskupan Ipil); meskipun untuk kerjasama apostolik, Kepulauan Sulu (Vikariat Apostolik Jolo) dimasukkan ke dalam provinsi gerejawinya.
Wilayah gerejawi tersebut menjadi keuskupan pertama di Mindanao pada 1910, dan didirikan sebagai keuskupan agung kedua Mindanao pada 1958. Pada saat ini, keuskupan agung tersebut meliputi wilayah darat seluas 1,648 kilometer persegi dan memiliki populasi 442,345, di mana 81 persen di antaranya adalah umat Katolik. Keuskupan agung tersebut meliputi 26 paroki, yang diurus oleh imam diokesan dan 18 imam relijius. Terdapat juga 51 suster relijius yang berkarya di keuskupan agung tersebut.