Kegubernuran Khan Yunis (bahasa Arab:محافظة خان يونسcode: ar is deprecated Muḥāfaẓat Ḫān Yūnis) adalah satu dari 16 kegubernuran di Palestina yang terletak di Jalur Gaza selatan.[1] Ibu kota distriknya adalah Khan Yunis. Kegubernuran ini dihuni oleh kurang lebih 280.000 jiwa. Luas daratannya terdiri dari 69,61% kota, 12,8% desa, dan 17,57% kamp pengungsi Khan Yunis.
