Joel Asaph Allen (19 Juli 1838–29 Agustus 1921) adalah seorang zoologis, mamalogis, dan ornitologis asal Amerika Serikat. Ia menjadi presiden pertama American Ornithologists' Union, kurator pertama burung dan mamalia di American Museum of Natural History, dan kepala Departemen Ornitologi pertama dari museum tersebut. Ia dikenal karena aturan Allen, yang menyatakan bahwa tubuh endotermae (mamalia berdarah hangat) berbentuk beragam karena iklim, yang meningkat di kawasan permukaan dengan iklim panas sampai kurang hangat, dan terminimalisir di kawasan permukaan beriklim dingin.
