Paus Benediktus XV mengangkatnya pada 4 Mei 1916 menjadi Uskup Amazonas. Ia mulai menjabat pada 15 Oktober. Pada 27 Maret 1924, Paus Pius XI mengangkatnya menjadi Uskup Agung Belém do Pará. Ia mulai menjabat pada 23 Januari 1925. Pada 1 Mei 1931, Paus Pius XI menerima pengunduran diri dari João Irineu Joffily dan mengangkatnya menjadi uskup tituler Anasartha.