Pengungsian perahu Mariel tahun 1980

Sekelompok kecil warga Kuba mencari perlindungan di kedutaan Peru dengan menerobos pagar pembatas menggunakan bus. Kuba meminta para pejabat kedutaan untuk menyerahkan warga Kuba tersebut kepada petugas keamanan Kuba. Peru menolak dan pemerintah Kuba menanggapi dengan menarik petugas keamanan Kuba yang melindungi kedutaan. Sekitar 10.000 warga Kuba kemudian mencari suaka di kedutaan. Kuba kemudian membuka pelabuhan Mariel dan mengizinkan warga Kuba yang ingin beremigrasi untuk pergi dengan kapal, yang memicu eksodus sekitar 125.000 orang.^[5]

Era Pasca Perang Dingin

Hubungan tetap tegang bahkan setelah Perang Dingin berakhir. Contohnya adalah insiden yang terjadi setelah dukungan Peru terhadap resolusi PBB tahun 2004 yang mengkritik catatan hak asasi manusia di Kuba. Hal ini mendorong Fidel Castro untuk berbicara keras menentang Peru dan presidennya, yang menyebabkan Peru menanggapi dengan menarik duta besarnya.^[6][7][8] Pada tahun 2010, peningkatan umum dalam hubungan luar negeri Kuba yang terjadi setelah naiknya Presiden AS Barack Obama telah kehilangan momentum. Namun, baik Kuba maupun Peru dengan cepat mengesampingkan perbedaan mereka saat mereka bekerja sama dalam memberikan bantuan kemanusiaan bagi korban gempa bumi Chili 2010.^[9]

Setelah kematian Fidel Castro pada tahun 2016, sejumlah besar rangkaian bunga ditinggalkan di kedutaan Kuba di Lima.^[10] Lima tahun kemudian, selama protes Kuba tahun 2021, kedutaan—yang sekarang berada di lokasi lain—dirusak oleh orang-orang tak dikenal yang melemparkan cat merah ke gedung tersebut.^[11][12]