Hau pernah keluar dari Kuomintang untuk membentuk Partai Baru, yang cenderung kepada usaha reunifikasi dengan Tiongkok daratan. Setelah Partai Baru mengalami kekalahan berturut-turut di dalam pemilihan anggota parlemen, ia menerima tawaran pemerintah berkuasa untuk memasuki kabinet pemerintahan untuk jabatan ketua Dewan Administrasi Prevervasi Lingkungan (環境保護署) di Eksekutif Yuan.
Menjelang berakhirnya masa jabatan Ma Ying-jeou pada tahun 2006, ia mencalonkan diri sebagai kandidat Kuomintang untuk pemilihan wali kota Taipei. Faktor penting dari kemenangannya dalam pemilihan kali ini adalah dukungan kepada Ma Ying-jeou selain daripada karisma Hau sendiri di kancah politik.