Halte Malioboro merupakan salah satu tempat pemberhentian bus aglomerasi Trans Jogja. Halte ini terbagi menjadi 3 bangunan yang di mana ketiganya melayani rute yang sama. Nama halte ini diambil dari letak ketiga bangunan tersebut, di Jalan Malioboro.
Malioboro 1
Malioboro 1 merupakan halte paling utara dari tiga halte Malioboro yang berlokasi di depan Hotel Grand Inna Malioboro.[1] Di sebelah utara halte berdiri Stasiun Yogyakarta, sehingga memudahkan penumpang untuk melakukan perpindahan moda dari bus ke kereta api maupun sebaliknya. Di sebelah selatan halte terdapat pusat perbelanjaan Plaza Malioboro dan Malioboro Mall.
Malioboro 2 merupakan halte yang terletak di bagian tengah dari tiga halte Malioboro dan berlokasi di kawasan Kepatihan.[1] Halte ini berada di depan kompleks bangunan pemerintahan, seperti Kantor Gubernur Daerah Istimewa Yogyakarta Tourist Information Centre, dan lain-lainnya.[1] Di sisi utara halte terdapat pusat perbelanjaan Plaza Malioboro dan Malioboro Mall.
