Dalam bidang kimia, Stahl diingat akan teori phlogiston. Ia juga memainkan peranan penting dalam biokimia.
Stahl juga membuat hipotesis bahwa semua materi punya kekuatan vital, atau semacam jiwa. Ia membakar kayu, dan dari massa abu hasil pembakaran yang lebih kecil, Stahl mengatakan bahwa kekuatan vital kayu tersebut telah pergi, karena kayu itu telah "dibunuh" dalam proses pembakaran.
Tulisan-tulisannya yang paling penting adalah Zymotechnia fundamentalis sive fermentalionis theoria generalis (1697), which contains the phlogistic hypothesis; Specimen Becherianum (1702); Experimenta, observationes, aniniadversiones ... chymicae et physicae (1731); Theoria medica vera (1707); Ars sanandi cum expectalione (1730).
Referensi
Carvallo, Sarah (2006). "Stahl, Leibniz, Hoffmann and breathing". Revue de synthèse / Centre international de synthèse. 127 (1): 43–75. PMID17153053.;
Magyar, László András (2005). "[Stahl on disease of courtiers]". Orvosi hetilap. 146 (48): 2468–9. PMID16408388.;
Helm, J (2000). "["Quod naturae ipsae sint morborum medicatrices." Hippocratism of Georg Ernst Stahl]". Medizinhistorisches Journal. 35 (3–4): 251–62. PMID11210365.;
Konert, J (1997). "Academic and practical medicine in Halle during the era of Stahl, Hoffmann, and Juncker". Caduceus (Springfield, Ill.). 13 (1): 23–38. PMID9357114.;
Gyözö, B (1996). "[Friedrich Hoffmann and Georg Ernst Stahl, classic representatives of baroque medicine]". Orvosi hetilap. 137 (10): 531–3. PMID8713669.;
Bednarczyk, A (1981). "[Antimechanistic materialism in the 18th century philosophy of medicine. G. E. Stahl (1659-1734) and animism]". Archiwum historii medycyny. 44 (2): 163–87. PMID7025787.;