Piala-piala pertama dan penampilan di Eropa
Tak lama setelah memenangkan kejuaraan Eerste Divisie, klub mengumumkan bahwa namanya akan diubah kembali menjadi PEC Zwolle.[4]
Pada tahun 2014, di bawah bimbingan pelatih kepala baru Ron Jans, PEC Zwolle meraih trofi besar pertama mereka dengan memenangkan Piala KNVB, mengalahkan juara liga Ajax 5–1 di final. Dengan demikian, PEC Zwolle lolos ke Liga Europa UEFA untuk pertama kalinya.[5] Pada tanggal 3 Agustus 2014, PEC Zwolle juga memenangkan Johan Cruijff Schaal (Piala Super Belanda) 2014 dengan mengalahkan AFC Ajax, kali ini dengan skor 1–0.[6]
Dengan memenangkan Piala KNVB, PEC Zwolle lolos ke Liga Europa UEFA 2014–15. Pada babak play-off, Zwolle bermain melawan AC Sparta Prague dan setelah hasil imbang 1–1 di Zwolle, mereka kalah 3–1 di Prague, sehingga kalah agregat 2–4.[7]
Masa-masa selama Eredivisie
Setelah memenangkan Piala KNVB 2014, PEC Zwolle berhasil mencapai final lagi pada tahun 2015. Kali ini mereka bermain melawan FC Groningen dan kalah dengan skor 2–0.[8]
Tahun-tahun berikutnya, Zwolle relatif stabil. Pada tahun 2017 dengan pelatih kepala baru John van 't Schip, PEC Zwolle mengalami salah satu tahun paling sukses yang pernah ada, berada di posisi ketiga selama jeda musim dingin. Namun, setelah jeda musim dingin, Zwolle mengalami kebalikan dari apa yang terjadi sebelumnya; mereka kalah dalam semua pertandingan dan akhirnya berada di posisi ke-9 pada tahun 2018.[9] Musim 2018–2019 Zwolle mengalami awal yang sangat buruk. Selama jeda musim dingin 2018/2019, Zwolle berjuang untuk bertahan di Eredivisie, berada di posisi ke-15. Pelatih John van 't Schip dipecat setelah ini.[10] Pada tahun 2018, Zwolle mendapatkan poin paling sedikit di Eredivisie; 26 poin.
Pelatih baru Jaap Stam menggantikan pendahulunya dan berhasil menyelamatkan Zwolle. Ia menang dengan skor 3–1 melawan Feyenoord,[11] 0 - 2 melawan Heracles Almelo,[12] dan 4 - 3 melawan FC Utrecht.[13] Pada akhir musim 2018–2019, Zwolle berada di peringkat ke-13, terhindar dari degradasi.
Dua musim setelah 2018–2019, PEC Zwolle berulang kali nyaris terdegradasi, finis di posisi ke-15 dan ke-13. Namun, pada musim 2021–2022, PEC Zwolle kembali mengalami musim yang buruk. Pelatih Art Langeler mengundurkan diri dan asistennya juga mengundurkan diri.[14] Kali ini, Dick Schreuder direkrut sebagai pelatih kepala untuk menyelamatkan Zwolle dari degradasi. Meskipun awalnya sukses, ia gagal mencegah degradasi dan Zwolle finis di posisi ke-18 pada tahun 2022, terdegradasi ke divisi dua di Belanda.
Kembalinya yang singkat ke Eerste Divisie
Pada tanggal 3 Maret 2023, Zwolle meraih kemenangan 13–0 atas FC Den Bosch dalam pertandingan liga, dan tim tersebut memecahkan sejumlah rekor dalam prosesnya.[15][16] Pertama, pertandingan tersebut menjadi kemenangan terbesar dalam sejarah Eerste Divisie,[15][16][17] serta kemenangan terbesar kedua dalam sejarah sepak bola Belanda (sama dengan kemenangan tandang Ajax 0–13 atas VVV-Venlo pada Oktober 2020).[15][17] Kedua, Zwolle menjadi tim Belanda pertama sejak Agustus 2002 ( Heracles Almelo menjadi pemecah rekor sebelumnya) yang menutup babak pertama pertandingan resmi dengan keunggulan 7–0.[15][16] Dalam pertandingan yang sama, pemain Zwolle Apostolos Vellios mencetak tiga gol dalam waktu hampir dua belas menit sejak kick-off dimulai, sebelum mencetak satu gol lagi di akhir pertandingan: akibatnya, striker Yunani itu mencetak hat-trick tercepat dalam sejarah divisi dua Belanda.[16][18] Pemain PEC Lennart Thy meraih penghargaan pencetak gol terbanyak di Eerste Divisie musim ini, setelah mencetak 23 gol dalam 36 penampilan.[19] Zwolle langsung promosi kembali ke Eredivisie di akhir musim, finis di posisi kedua klasemen liga.[20][21][22]