Selama perang, Serikat dihadapkan dengan masalah bagaimana mengelola daerah-daerah yang berhasil direbut dan bagaimana menangani para budak yang melarikan diri ke barisan Serikat. Dalam banyak kejadian, Angkatan Darat Amerika Serikat memainkan peran yang vital dalam membangun ekonomi kerja bebas di Selatan, melindungi hak-hak hukum orang bebas, dan membuat lembaga-lembaga pendidikan dan keagamaan. Meskipun enggan untuk campur tangan dengan lembaga perbudakan, Kongres mengesahkan Undang-Undang Penyitaan untuk menyita budak-budak Konfederasi, memberikan preseden bagi Presiden Abraham Lincoln untuk mengeluarkan Proklamasi Emansipasi. Kongres kemudian membentuk sebuah Biro Orang Bebas untuk memberikan makanan dan perlindungan yang sangat dibutuhkan kepada budak yang baru dibebaskan.
