Berikut adalah Daftar perguruan tinggi swasta di Kabupaten Banyumas, yang pembinaannya berada di bawah Kementerian Pendidikan Tinggi, Sains, dan Teknologi Republik Indonesia dan Perguruan Tinggi Swasta Keagamaan, yang pembinaannya berada di bawah Kementerian Agama. Daftar ini tidak termasuk Perguruan Tinggi Kedinasan yang pembinaannya berada dibawah masing-masing kementerian/lembaga.

Universitas & Institut

• Universitas Wijayakusuma Purwokerto
• Telkom University Purwokerto
• Universitas Muhammadiyah Purwokerto
• Universitas Amikom Purwokerto
• Universitas Nahdlatul Ulama Purwokerto
• Universitas Harapan Bangsa Purwokerto
• Universitas Bina Sarana Informatika Purwokerto

Sekolah Tinggi

• Sekolah Tinggi Teknik Wiworotomo Purwokerto
• Sekolah Tinggi Ilmu Komputer Yos Sudarso
• Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer Widya Utama
• Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Bina Cipta Husada
• Sekolah Tinggi Ilmu Ekonomi Satria
• Sekolah Tinggi Teologi Diakonos Banyumas
• Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Ibnu Sina Ajibarang

Akademi

• Akademi Pertanian HKTI Banyumas-Cilacap-Kebumen
• Akademi Farmasi Kusuma Husada Purwokerto

Politeknik

• Politeknik Pratama
• Politeknik Yakpermas
• Politeknik Gusdurian