Pada zaman Hindia Belanda, Kecamatan Cipayung secara administratif merupakan bagian dari gemeente Meester Cornelis yang sekarang merupakan wilayah Kecamatan Jatinegara dan bagian dari Kawedanan Kramat Jati tahun 1950-an.
Kecamatan Cipayung dimekarkan dari Kecamatan Pasar Rebo sekitar tahun 1992.
Pembagian administratif
Kel. LUBANG BUAYA, DENGAN KODE POS 13810
Kel. CEGER, DENGAN KODE POS 13820
Kel. CIPAYUNG, DENGAN KODE POS 13840
Kel. MUNJUL, DENGAN KODE POS 13850
Kel. PONDOK RANGGON, DENGAN KODE POS 13860
Kel. CILANGKAP, DENGAN KODE POS 13870
Kel. SETU, DENGAN KODE POS 13880
Kel. BAMBU APUS, DENGAN KODE POS 13890
Transportasi
Terdapat satu lapangan terbang di kecamatan ini yaitu Bandar Udara Wiladatika yang terletak di kompleks Buperta yang masuk dalam wilayah kelurahan Munjul.[2][3][4]
.svg){kind=small}
