Basis data ini, awalnya dikenal sebagai StARlite, dikembangkan oleh sebuah perusahaan bioteknologi bernama Inpharmatica Ltd. yang kemudian diakuisisi oleh Galapagos NV. Data tersebut diperoleh untuk EMBL pada 2008 dengan penghargaan dari The Wellcome Trust, menghasilkan pembentukan kelompok kemogenomika ChEMBL di EMBL-EBI, yang dipimpin oleh John Overington.[2][3]
↑Overington J (April 2009). "ChEMBL. An interview with John Overington, team leader, chemogenomics at the European Bioinformatics Institute Outstation of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL-EBI). Interview by Wendy A. Warr". J. Comput.-Aided Mol. Des. (dalam bahasa Inggris). 23 (4): 195–8. Bibcode:2009JCAMD..23..195W. doi:10.1007/s10822-009-9260-9. PMID19194660.
