Nama daerah ini berasal dari frasa bubak yasa. Daerah yang dulunya hutan jati ini pernah ditebang oleh Sunan Kalijaga dan para pengikutnya ketika mencari pohon jati untuk pembangunan Masjid Agung Demak.[1]
Pada tahun 2014, PT Karyadeka Alam Lestari, pengembang kota terencana BSB (Bukit Semarang Baru), mengumumkan pembangunan cabang di wilayah Bubakan bernama BSB Village.[2] Proyek ini mulai dibuka untuk umum pada tahun 2018.[3]
