Batavia FC awalnya didirikan pada tahun 2010 berhome base di Stadion PSPT Tebet oleh Muhammad Firdaus pemilik Yayasan RMD sebagai sekolah berbasis sepak bola, setelahnya Batavia FC mengikuti kompetisi-kompetisi Asprov PSSI Jakarta dan Liga 3 Provinsi yang di adakan PSSI pada awal di bentuknya kompetisi, di tahun 2021 Batavia FC di akuisisi oleh Gede Widiade sebagai pemilik PSF Grub. Gede Widiade tidak mengubah nama club Batavia FC namun melakukan rebranding logo club serta visi misi dan merombak semua elemen club serta berpindah home base ke Pancoran Soccer Field.