Fase sistem gugur Liga Champions AFC 2023–2024 dimulai pada 13 Februari dengan babak 16 besar dan akan berakhir pada 18 Mei 2024 dengan final untuk menentukan juara Liga Champions AFC 2023–2024.[1] Sebanyak 16 tim bertanding di fase gugur.
Tim
Pemenang grup dan tiga runner-up terbaik di penyisihan grup dari masing-masing wilayah melaju ke babak 16 besar, dengan Wilayah Barat (Grup A–E) dan Wilayah Timur ( Grup F – J) memiliki delapan tim yang lolos.
Di babak sistem gugur, 16 tim akan memainkan turnamen eliminasi tunggal, dengan tim dibagi menjadi dua wilayah hingga final. Setiap pertandingan dimainkan dengan sistem kandang dan tandang dua pertandingan. Waktu tambahan dan adu penalti digunakan untuk menentukan pemenang jika diperlukan (perhatikan bahwa aturan gol tandang telah dihapuskan) (Peraturan Pasal 10.1).[2] Urutan pertandingan (kandang vs tandang) ditentukan melalui pengundian, kecuali final. Final telah ditentukan sebelumnya secara bergilir, dengan leg pertama akan diselenggarakan oleh tim dari wilayah Timur. Pertandingan ditentukan dalam undian tunggal yang dilakukan pada 28 Desember 2023.
