Aji Adipati Saparudin adalah seorang Raja yang memerintah Kerajaan Berau pada tahun 1624-1650 atau sekitar 26 tahun. Beliau merupakan raja ke-11 Kerajaan Berau menggantikan saudaranya Aji Pangeran Tua setelah musyawarah kerajaan. Sebelumnya, Beliau adalah seorang Mangkubumi kerajaan ketika pemerintahan saudaranya Aji Pangeran Tua (1600-1624).

Awal Terpecahnya Kerajaan Berau menjadi Dua

Setelah Ayahnya wafat, terjadi masalah internal kerajaan di antara Beliau dengan saudara berbeda ibu, yakni Aji Pangeran Tua, mereka berdua sama-sama ingin menjadi Raja menggantikan ayah mereka.

Dari masalah tersebut, kemudian diadakan musyawarah kerajaan. Dari musyawarah tersebut, Kerajaan Berau dibagi menjadi dua kekuasaan dalam satu negara, yakni sebagai berikut:

1. Aji Pangeran Tua menguasai daerah sebelah selatan Sungai Kuran menuju hulu sungai sampai kiri Sungai Kelay (Wilayah modernnya mencakup beberapa kecamatan, yaitu: Tanjung Redeb, Teluk Bayur, Sambaliung, Kelay, Tabalar, Biatan, Talisayan, Batu Putih dan Biduk-Biduk).
2. Aji PAngeran Adipati menguasai daerah sebelah utara Sungai Kuran menuju hulu sampai wilayah kanan dan kiri Sungai Segah (Wilayah modernnya mencakup beberapa kecamatan, yaitu: Gunung Tabur, Segah, Pulau Derawan dan Maratua).
3. Penobatan Raja selanjutnya dilakukan secara bergantian dari masing-masing kedua keturunan. Dimulai dari Aji Pangeran Tua, kemudian dilanjutkan ke Aji Pangeran Dipati, kemudian keturunan Aji Pangeran Tua, kemudian keturunan Aji Pangeran Dipati, dan begitu seterusnya.