Desa Air Molek Il terletak di wilayah Kecamatan Pasir Penyu Kabupaten Indragiri hulu yang menurut orang dahulu dikenal dengan nama Lembah Dusun yang artinya desa terletak di lembah dan tanahnya berbentuk berdusun-dusun atau berbentuk petak-petak seperti sawah, setelah itu terbagi dua menjadi Air Molek I dan Air Molek II. Desa Air Molek II tidak pernah kekeringan karena terletak didataran rendah atau lembah yang banyak mata air dan terkenal dengan Air Molek karena airnya sangat molek atau jernih.
Desa Air Molek II mulai terbentuk pada tahun 1937 yang dipimpin oleh Lurah Sonto dengan sebutan Kelurahan Jawa, karena pada waktu itu di Kecamatan Pasir Penyy terbagi menjadi 3 kelurahan, yaitu:
1. Kelurahan Nagari yang terletak di Air Molek I sekarang:
2. Kelurahan Melayu yang terletak di Desa Lembah Dusun Gading:
3. Kelurahan Jawa yang didomisili suku Jawa, dan Air Molek II termasuk ke dalam Kelurahan Jawa.
Lurah Sonto ini terkenal dengan kekuasaan turun-temurun dengan pemerintah selama 15 tahun. Pada tahun 1952 Lurah Sonto meninggal duria, digantikan anaknya Supardi atau Lelur, sampai tahun 1974 dan setelah meninggal dunia digantikan oleh anak Supardi yang bernama Suradi yang menjabat sampai tahun 1989. Semasa kepemimpinan Sumadi, Kelurahan Jawa berganti nama menjadi Desa Air Molek II.
Pada tahun 1990 Desa Air Molek Il mengadakan pemilihan kepala desa secara langsung dan yang terpilih adalah Sugio dengan masa jabatan 8 tahun. Tahun 1998 diadakan pemilihan kepala desa yang kedua, dan kepala desa yang terpilih adala Rasyid Syarif dengan masa jabatan 5 tahun. Tahun 2003 diadakan pemeilihan kepala desa cembali secara langsung yang ketiga, yang terpillih Sukardi dengan masa jabatan 5 ahun. Tahun 2009 diadakan pemilihan kepala desa secara langsung yang ke empat, yang terpilih adalah Sukardi masa jabatan 5 tahun. Pada tahun 2014 diadakan pemilihan kepala desa secara lagsung yang kelima, yang terpilih adalah Mitra Ariadi, S.Sos dari tahun 2014 sampai dengan sekarang.
Dari tahun 1990 sampai dengan 2015 sudah dilaksanakan 5 kali pemilihan kepala desa secara langsung di Desa Air Molek Il
Gambaran Umum Desa Air Molek II
A. Demografi Desa
Desa Air Molek II terletak di dalam wilayah Kecamatan Pasir Penyu Kabupaten Indragiri Hulu Provinsi Riau dengan luas wilayah + 6,5 Ha, ketinggian dari permukaan laut
(DPL) 25 M, suhu udara rata-rata 19,5Pcc sampai dengan 34,2°cc, jarak dari kabupaten 38 KM, jarik dari pusat pemerintahan kecamatan 0,3 KM, jarak dari ibukota provinsi 175 KM.
a) Batas Wilayah Desa
Letak geografi Desa Air Molek II terletak di antara:
Sebelah Utara  : Kelurahan Tanjung Gading
Sebelah Selatan  : Kelurahan Air Molek I
Sebelah Barat  : Desa Lembah Dusun Gading
Sebelah Timur  : Desa Candirejo
b) Luas Wilayah Desa
| 1. Pemukiman |
:3 ha |
| 2. Pertanian/Perkebunan |
:2 ha |
| 3. Ladang/tegalan |
:- ha |
| 4. Hutan |
:- ha |
| 5. Rawa-rawa |
: -ha |
| 6. Perkantoran |
: 0,5 ha |
| 7. Sekolah |
: 0,2 ha |
| 8. Jalan |
: 0.3 ha |
| 9. Lapangan sepak bola |
: - ha |
c) Orbitasi
1. Jarak ke ibu kota kecamatan terdekat  : 0,3 km
2. Lama jarak tempuh ke ibu kota kecamatan  : 5 menit
3. Jarak ke ibu kota kabupetan  : 35 km
4. Lama jarak tempuh ke ibu kota Kabupaten  : 45 menit
d) Jumlah penduduk berdasarkan jenis kelamin
1. Kepala Keluarga  : 289 KK
2. Laki-laki  : 562 Jiwa
3. Perempuan  : 482 jiwa
4. Jumlah  : 1.044 jiwa
B. Pembagian Wilayah Desa
Desa Air Molek II terbagi ke dalam 4 Dusun terdiri dari:
1. Dusun I Â : Jumlah 1 RW dan 1 RT
2. Dusun II Â : Jumlah 1 RW dan 1 RT
3. Dusun III Â : Jumlah 1 RW dan 2 RT
C. Strukrur Organisasi Pemerintahan Desa
a. Lembaga Pemerintah Desa
1. Kepala Desa  : 1 orang
2. Sekretaris Desa  : 1 orang
3. Perangkat Desa  : 7 orang
b. Badan Permusyawaratan Desa (BPD)Â : 7 orang
c. Lembaga Kemasyarakatan
1. LPM 1
2. PKK 1
3. Posyandu 2
4. Pengajian  : 6 kelompok
5. Arisan  : 2 kelompok
6. Simpan Pinjam :10 kelompok
7. Kelompok Tani  : 1 kelompok
8. Gapoktan  : 1 kelompok
9. Karang Taruna  : 1 kelompok
10. Risma  : 0 kelompok
11. Ormas/ LSM Â : 2 kelompok
12. Lain-lain  : 2 kelompok
d. Nama- Nama Aparat Desa
Penjabat Kepala Desa  : SYAMSIR ARSYAD
Sekretaris Desa  : CANDRA ROSYADI, S.Pi
Kepala Urusan Pemerintahan  : HENDRI
Kasi Kesejahteraan dan Urusan Umum  : WIWIN AFRIANTI Kepala
Urusan Pembangunan  : AZMAIZON FADHLI
Kepala Urusan Keuangan  : AZMAIZARTI, S.Pd
Kepala Dusun
1. Dusun I Â : SETIA BUDI
2. Dusun I1 Â : FERI AGUSTIAN
3. Dusun III Â : ASMADIANTO
e. Nama-nama Anggota Badan Permusyawaratan Desa (BPD)
Ketua  : BAMBANG SUHENDRA
Wakil Ketua  : HARI KURNIADI
Sekretaris  : DEVI SUSANA
Anggota  : 1. SAID HASAN
2. MALIK SYIFULLIZEN
3. MARIANTO
4. ANDES NOFRITA